Les maladies intestinales inflammatoires sont des maladies inflammatoires chroniques  qui sont d'étiologie inconnue. Ces maladies progressent  soit par poussées soudaines intermittentes interrompues par des périodes de rémissions soit sur un mode progressif actif et chronique. Les maladies intestinales inflammatoires incluent la maladie de Crohn et la colite ulcérative. Le diagnostic clinique et échographique est souvent un défi, expliquant par conséquent le délai important entre le début de la maladie et le déclenchement de la thérapeutique.
La maladie de Crohn se présente habituellement avec de la douleur, de la diarrhée et la perte de poids.

Echographie :
La jonction iléo-caecale terminale est impliquée dans la majorité de cas, elle est épaissie;  et souvent la paroi hypoéchogène des anses peut être mis en évidence dans cette zone. L'épaississement inflammatoire des intestins est généralement diffus et concentrique.
Dans la maladie de Crohn il y a une bordure externe hypoéchogène bien défini et une zone interne hyperéchogène; les coupes transversales peuvent démontrer une lésion en cible. L'épaississement des anses peut être local ou touchant un long segment, on peut aussi observer des lésions caractéristiques en saut. Une épaisseur de paroi de plus de 3 millimètres est considérée comme anormale. L'échographie peut être employé pour identifier les complications de la maladie de Crohn, identifier les patients à risque, et suivre les patients pour les récidives de la maladie après la chirurgie.
La maladie de Crohn affecte l'épaisseur entière la paroi des anses, et l'une des complications fréquentes est celui des abcès intra-muraux. Ceux-ci peuvent être parfois vus dans la paroi épaissi comme des bulles de gaz : des zones fortement échogènes. Si grands, ils peuvent perforer, donnant une collection purulente mal définie, qui peut être drainée en percutanée.
Les fistules sont une autre complication de la maladie de Crohn, et sont plus faciles à démontrer avec la radiographie de contraste.
Les maladies inflammatoires intestinales augmentent la perfusion de l'intestin, diminuant la résistance vasculaire.
Dans la maladie de Crohn et la colite ulcérative et comparés aux sujets normaux, le Doppler de l'artère mésentérique supérieure montre une augmentation des vitesses d'écoulement touchant les deux pointes systolique et diastolique, et une diminution d'index de résistance dans de nombreux types d'anses pathologiques, y compris la maladie de Crohn.  
Chez les patients présentant une maladie de Crohn active l'écoulement est 826 le ± 407ml/min (gamme 242-1455ml/min). Un certain chevauchement est présent. Si la valeur seuil ou moins de 500mL/min est employée, une sensibilité de 83 % et de spécificité de 87 % peut être réalisée pour une maladie de Crohn active.
Des changements de l'index de résistance se sont avérés être liés à l'activité de la maladie de Crohn, ce qui pourrait prouver la valeur de la surveillance au doppler des patients présentant cette maladie.
Les produits de contraste peuvent aider à différencier les plages fibreuses des zones  inflammatoires, et à distinguer les masses inflammatoires des abcès intra-abdominaux.
La détection échographiques des adénopathies locales anormales est plus fréquente chez les jeunes patients, suggérant  une phase précoce de la maladie et la présence des complications septiques telles que les fistules et les abcès.
La maladie de Crohn est associée au stéatose hépatique, aux abcès hépatiques, aux calculs biliaires, au cholécystite, au cholangite sclérotique, au carcinome hépatocellulaire, au carcinome biliaire, au calcul rénal et à l'amyloïdose rénale.

 Diagnostic différentiel :
D'autres pathologies peuvent donner des anses épaississes :
* Colite (Amibiase. Colite pseudomembraneuse. Entérocolite nécrotique).   
* Appendicite.
* diverticulites
* invagination intestinale
* Tuberculose iléo-caecale
* Abcès.
* oedème : hypoalbuminaemie, hypertension portale, péricardite constrictive.
* Syndrome de Zollinger-Ellison.
* Fibrose kystique.
* Sprue.
* Entéropathie avec perte de Protéine.
* Chimiothérapie de Cancer.
* Ischémie et hémorragie intra-murale.
* Congestion veineuse comprenant le malrotation et le volvulus chronique.
* Lymphangiectasie intestinale.
* Purpura de Henoch-Schônlein (accentuation de la muqueuse).
* La maladie inflammatoire pelvienne.
* traumatisme.
* Gastroentérite (y compris l'entérite éosinophile).
* Giardiase.
* Iléite à Yersinia.
* Iléocolite à campylobactérie.
* Iléite à salmonelles.
* Anisakiase.
* Amyloidose.
* La maladie de Whipple.
* Giardiase ou strongyloidiase.
* Le syndrome de Behçet, l'aspect est semblable à la maladie de Crohns.
* Radiation.
* Lymphome.
* La maladie coeliaque.
* Dermatomyosite.
* adénocarcinome.
* Tumeurs y compris les métastases.
* Pneumatose intestinales.
* Péritonite.
* Le sarcome de Kaposi.

L'échographie est aussi utile pour le diagnostic différentiel avec la pathologie tubo-ovarienne.

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